L'Ente Parco è un "Ente pubblico autonomo non economico" la cui attività è regolata dalla legge quadro sulle aree protette: la 394 del 1991.
L'Ente Parco è sottoposto alla vigilanza del Ministero dell'Ambiente.
Gli organi dell'Ente Parco sono:
Il Presidente del Parco:
- Sen. Fausto Giovanelli
Il Consiglio Direttivo:
Organo di indirizzo e controllo politico - Amministrativo dell'Ente Parco
- Giovanelli Fausto
- Meo Gabriella
- Martinelli Luca
- Ugolotti Robertino
- Mariani Raffaella
- Sassi Elio
- Maffei Antonio
- Claudio Riani
- Rossella Gafà
La Giunta Esecutiva
- Giovanelli Fausto
- Mariani Raffaella
- Riani Claudio
Il Collegio dei Revisori dei Conti
Organo di vigilanza e controllo sulla gestione contabile dell'Ente Parco, il Collegio dei Revisori dei Conti è così composto:
- Dott. Brogi Dario Presidente, in rappresentanza del Ministero dell'Economia e delle Finanze
- Dott.ssa Paola Guasconi - Componente, in rappresentanza del Ministero dell'Economia e delle Finanze
- Dott. Edoardo Fanucci - Componente, in rappresentanza della Regione Toscana e della Regione Emilia Romagna
La Comunità del Parco
E' composta dai rappresentanti di tutti gli Enti Locali (Comuni, Comunità Montane, Province) su cui si estende il Parco nazionale e delle Regioni Toscana ed Emilia Romagna.
Presiente della Comunità di Parco è Annalisa Folloni sindaco del comune di Filattiera (MS).
Vice-Presidente della Comunità del Parco è Giuseppe Del Sante sindaco del comune di Corniglio (PR).
